IAI Wilayah Yogyakarta menjalin kerjasama dengan berbagai pihak
seperti kegiatan bersama dengan mahasiswa dari perguruan tinggi;
Universitas Gadjah Mada (UGM),
Universitas Negeri Yogyakarta (UNY),
Universitas Islam Indonesia(UII),
Universitas Muhammadiyah Yogyakarta (UMY),
Sekolah Tinggi Ilmu Ekonomi (STIE) YKPN
Akademi Akuntansi (AA) YKPN,
Universitas Sanatha Dharma (USD),
Universitas Ahmad Dahlan (UAD),
Universitas Janabadra
D3 Sekolah Vokasi UGM,